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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
10/03/2008 |
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Data da última atualização: |
14/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
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Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
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Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
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Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 407 | |
| 162. |  | ALVES FILHO, E. G.; BRITO, R. S.; RODRIGUES, T. H. S.; SILVA, L. M. A. e; BRITO, E. S. de; CANUTO, K. M.; KRUG, C.; ZOCOLO, G. J. Association of pollinators of different species of oil palm with the metabolic profiling of volatile organic compounds. Chemistry & Biodiversity, v. 16, n. 6, e19000, June 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 163. | | SILVA, L. M e; SOUSA, J. C.; PRATA, R. C.; LIMA, Y. B. de; SILVA, J. da; ALVES, M. C. S. Avaliação de mandioca de mesa (manihot esculenta l.) numa área de cultivo orgânico de hortaliças em São Miguel, no Rio grande do Norte. SIMPÓSIO EM AMBIENTE, TECNOLOGIA E SOCIEDADE, 1., [2018]. Mossoró. Anais do I Simpósio De Ambiente, Tecnologia e Sociedade. [Mossoró]: [UFERSA], [2018]. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 166. | | MELO, R. S. de; MACHADO, L. C.; GERALDO, A.; OLIVEIRA, L. A. de; FERREIRA, M.; DUTRA, R. M.; SILVA, L. M. Avaliação químico-bromatológica e do conteúdo de compostos cianogênicos residual de cinco frações obtidas a partir do processamento da rama da mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA, 1.; FEIRA INTERDISCIPLINAR DE FORMAÇÃO ACADÊMICA DO CEFET BAMBUÍ, 6., 2008, Bambuí. Semana de ciência e tecnologia CEFET Bambuí. Bambuí: CEFET, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 167. | | PINHO, B. R. B.; SANTOS, G. R.; DIAS NETO, J. J.; RANGEL, P. H. N.; SILVA, L. M. A.; CASTRO NETO, M. D.; CANJÃO, E. R. Avaliação de genótipos de arroz sob condições de várzeas no sul do Estado do Tocantins. Tropical Plant Pathology, v. 33, p. S 208, ago. 2008. Suplemento. ref. MEL-038. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, MG, ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 170. | | SILVA, L. M. da; SILVA, A. P. da; CAMPOS, T. de; OLIVEIRA, L. C. de; RODRIGUEZ, A. F. R.; WADT, P. G. S.; HUNGRIA, M. Atributos químicos e microbiológicos em sistemas de manejo de solo no sudoeste da Amazônia: resultados de pesquisas. In: FARIA, M. A. da S.; RIBEIRO, M. J.; RIBEIRO, P. de L. S. (org.). Tópicos em biotecnologia e biodiversidade: pesquisas e inovação na Amazônia Sul Ocidental. Rio Branco, AC: Edufac, 2017. cap. 1, p. 14-29.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 173. | | SILVA, L. M. da; FAUSTINO, C. de L.; FONSECA, F. L. da; WADT, L. H. de O.; COSTA, F. de S.; WADT, P. G. S. Ciclagem de nutrientes e caracterização do solo sob castanha-do-brasil. In: SEMINÁRIO ANUAL DE COOPERAÇÃO UFAC/UF, 7., 2009, Rio Branco. Parcerias em pesquisa e ação para conservação e desenvolvimento sustentável: anais. Rio Branco, AC: Ufac, 2009. p. 313. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 175. | | RAMOS, L. N.; OHSE, B. J. G.; DIAS NETO, J. J.; SILVA, L. M. dos A.; SANTOS, G. R. dos; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E. Coleção de isolados monospóricos do agente causal da brusone do arroz (Magnaporthe grisea). SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.547.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 176. | | RAMOS, L. N.; OHSE, B. J. G.; DIAS NETO, J. J.; SILVA, L. M. dos A.; SANTOS, G. R. dos; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E. Coleção de isolados monospóricos do agente causal da brusone do arroz (Magnaporthe grisea). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasilia, DF. Anais...Brasilia, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 547.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 177. | | FERNANDES, D. R.; COSTA, V. M. D.; SILVA, L. M. F. da; LIMA, A. R.; PINHEIRO, R. R.; SOUZA, V. de. Comparação entre o método de contagem eletrônica e contagem microscópica na enumeração de células somáticas presentes em leite de cabra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUALIDADE DO LEITE, 6., 2015, Curitiba. Anais... Curitiba: CBQL, 2015. Resumo 43. p. 85-86.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Rondônia. |
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